马克思主义学院成立于1996年12月，由原马列主义发展史研究所和马克思主义理论教育研究所合并而成。2003年7月，经学校研究决定，原马克思主义学院和中共党史系合并组建成新的马克思主义学院。

　　目前，学院下设马克思主义理论研究所、马克思主义发展史研究所和中共党史系。其中，马克思主义理论研究所（原马克思主义理论与思想政治教育研究所）成立于1986年，主要研究马克思主义理论、思想政治教育、当代国外马克思主义、马克思主义中国化等。马克思主义发展史研究所（原马列主义发展史研究所）成立于1964年，是我国唯一的研究马克思主义发展史的科研机构。中共党史系始建于1950年代中期，主要研究中共党史党建和当代中国史。