1926年，著名经济学家、统计学家何廉由耶鲁大学博士毕业后，回国任南开大学商科财政和统计学教授，开设多门统计课程，并建立我国第一个物价指数-南开指数。1931年，南开大学成立我国第一个统计学系；1932年，创建我国第一本统计期刊-经济统计季刊；1958年，南开大学统计学系整建制移出，参与组建河北财经学院（现天津财经大学）。

　　现今的南开大学统计学科是上世纪五十年代，在王梓坤院士和胡国定先生奠定的概率论与数理统计专业基础上发展起来的。1981年，南开大学概率统计专业入选全国首批博士点；1983年，开始招收全国首届数理统计专业本科生。1999年，在南开大学数学科学学院成立统计学系。

　　在1988年、2002年、2007年进行的历次学科评估中南开概率统计均被评为国家二级重点学科。2011 年，国务院学位委员会把统计学调整为一级学科后，南开统计学获全国首批统计学一级学科博士学位授予权，2012年第三轮学科评估中并列全国第四，并入选全国首批统计学博士后流动站。2013年12月，成立南开大学统计研究院，原数学科学学院统计学系全体教师转入统计研究院；2017年，南开统计学科入选国家“双一流”建设学科，同年，在第四轮学科评估中并列全国第三（A）。

　　2018年5月，在全国率先成立了统计与数据科学学院，全面负责统计学一级学科本、硕、博、博士后，应用统计专业硕士，以及数据科学与大数据技术本科的人才培养工作。2019年，统计学本科专业获认定为国家级一流本科专业建设点。2022年，南开统计学再次入选国家“双一流”建设学科名单。

　　学院坚持“学科立院、人才强院、交叉互融”的办学理念，以创建统计学前沿理论与方法为核心，拉动数据科学学科发展；以统计学为抓手，与校内外相关学科深入交叉融合，扩大学科影响，主动服务社会。